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Published on November 21, 2007

Author: Mee12

Source: authorstream.com

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Slide1:  国际流行化学软件介绍 —量化材料篇 北京宏剑公司 2007.07 Slide2:  当20世纪90年代接近结束的时候,我们看到理论化学和计算化学的研究有了很大的进步,其结果使整个化学正在经历着一场革命性的变化。本次大会荣誉主席徐光宪院士提到:“进入21世纪以来,计算方法与分子模拟、虚拟实验,已经继实验方法、理论方法之后,成为第三个重要的科学方法,对未来科学与技术的发展,将起着越来越重要的作用。” 从20世纪80年代末出现的将理论化学成果结合分 子模型来进行分子设计的第一批带图象界面的计算机 软件到现在短短的二十几年来,理论与计算化学已经 为化学领域的各个分支学科解决了很多目前实验水平 所不能解决的课题,如分子筛的微观探测,固体在溶剂 中溶解过程的动态细节的捕捉,探索多相催化中的反 应机理等等. Slide3:  随着化学科研工作的不断深入开展,我们对计算软件的需求也正迅速增加。目前,北京宏剑公司已经将全世界100多家供应商的近300种化学软件引入中国,成为业界代理化学软件种类最多最全的代理商。这些产品包含了量化材料分子模拟与设计,生物药物分子模拟与设计以及数据库三大类,能够很好的解决化学领域的各种问题。 CANADA Hongcam BeiJing Hongcam Slide4:  量化计算: 量子化学的研究范围包括稳定和不稳定分子的结构、性能,及其结构与性能之间的关系;分子与分子之间的相互作用;分子与分子之间的相互碰撞和相互反应等问题。 Gaussian ADF MOLPRO MOLCAS JAGUAR … Slide5:  Gaussian是做半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学程序,功能 强大,计算内容十分广泛。可以模拟气相和溶液中的体系,基态和激发 态,还可以对周期边界体系进行计算。 Gaussian是研究诸如取代效应、 反应机理、势能面和激发态的有力工具。 Gaussian Gaussian03 D.01 增加功能 NMR核磁自旋耦合常数的计算分两步完成 NMR=Susceptibility要求同时计算出磁化率和核屏蔽张量 为Linda的使用者提供了一个新的Link0命令:%LindaWorkers Stable=(opt,QCOnly)可以用来在Stable=opt迭代SCF计算中排除排除常 规SCF(L502)的计算 增加了TPSSTPSS和BMK泛函 增加了Intel EM64T多处理器的支持 … Parallel calculations are supported on Windows systems Slide6:  MOLPRO 2006.1 有非常多的新功能,很多显著有效的密度拟合方法,明确的关联方法,局域耦合团簇方法和几个新的梯度程序。 1 更多相容的输入语言和输入预校验功能 2 更多灵活的基组输入,允许处理多基组 3 新的更有效的密度函数工具的加入 4 低-级比例的局域耦合团簇方法,带有微扰3重激发态处理 (LCCSD(T) 和变量,如 LQCISD(T)) 有效的Hartree-Fock和Kohn-Sham理论,二级Møller-Plesset 微扰理论(DF-MP2),和所有的局域方法(DF-LMP2, DF-LMP4, DF-LQCISD(T), DF-LCCSD(T)) 的密度拟合程序; …… 重点是高精度计算,广泛处理电子相关问题 Slide7:  MOLCAS给出的势能曲线可以精确的计算分子性质, 比如键长、能量和电子光谱。 能够计算分子的电子吸收谱, 包括化合价、和混合态。 研究所有化学领域的反应机理 MOLCAS 多组态的量化计算,特别适合激发态,过渡态的研究,含源码 功能:  功能 几何优化,过渡态,反应路径,红外频率 分子计算的广泛性和准确性 紫外-可见光谱,极化率,拉曼强度,范德华分散系数,手性分子的光学性质,NMR,自旋-自 旋耦合,g-张量,磁/电超精细张量,红外频率和强度,多极矩. 模拟溶剂,蛋白质和其他环境. 图形用户界面 显示多种输出结果:Kohn-Sham轨道,变形密度,静电势,模拟光谱,优化过程描述,分子轨 道相互作用图. 利用BAND研究聚合物和固体 均相和非均相催化,态密度,势能面分析,键合分析,Mulliken分析,电荷密度分析,碎片分析 研究态密度降解… 使用相对论方法,特别适用于处理重核. 分析 由碎片构建分子 ,键能分析,高级电荷密度和键级的分析 Slide9:  化学吸收体系或金属表面的化学反应 片段轨道组成分子轨道 效率,大分子的处理:  效率,大分子的处理 针对于共享内存和分布内存体系,如Linux集群,ADF的大部分都进行了有效并行化.对于大多数的标准计算,包括NMR,分析Hessian和TDDFT计算,ADF可以非常好的进行并行缩放. ADF还利用这样一个事实-距离较远的原子无相互作用.对于计算中最耗时的部分,此举将大大削减计算时间. 密度拟合过程降低了库仑势能评估的计算成本,利用冻核近似,可以大大缩减带有重核体系的计算时间. QM/MM Slide11:  J. AM. CHEM. SOC. 2005, 127, 3184-3190 超分子 Slide12:  催化剂 Organometallics 2004, 23, 2651-2657 [MeB(C6F5)3]- L2MMe+ (M = Ti, Zr) 氢迁移 Slide13:  磁性材料 J. Phys. Chem. A 2006, 110, 5096-5101 [Cr[CNMn(salen)(H2O)]6]3+ [(5-Brsalen)2(H2O)2Mn2Cr(CN)6] Slide14:  功能材料的电子性质和稳定性 Inorg. Chem. 2005, 44, 100-107 Jaguar:  Jaguar Jaguar是快速进行从头计算的程序,为加速基本的和应用型研究项目,以及使更高理论水平的计算成为可能而设计。 并行计算,波函和能量,平衡计算,溶剂计算 Slide16:  势能面 提供反应物,产物,过渡态的反应坐标;提供在内坐标中带有各自变量的势能面. 速度 速度快,处理更大的体系,而不必将复杂体系人为的简单化,保证体系构型的真实性. 精确度 Jaguar的表现能使更高级的理论方法得以实施,会得到更精确的能量和性质.应用自恰反应场 能处理溶剂化效应. 化学性质 NMR,IR,Pka,部分电荷,多耦极矩,极化率,分子轨道,电子密度,静电势,Mulliken布居,NBO 分析... Jaguar的快速计算引擎允许用户探讨真实世界中的实际问题,它在一个合理的时间周期内可以研究比以往更大的巨型体系,或者可以研究比以前更多的体系。在足够短的时间内与快速研究环境相结合达到化学要求的准确度。 JAGUAR Slide17:  北京宏剑公司 2007.07

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